在成功阻止了城市地下的可怕实验后，柯南等人的生活暂时恢复了平静。然而，这份平静并没有持续太久。
一天，柯南收到了一封神秘的邀请函。邀请函的封面是一个黑色的蝙蝠图案，没有寄件人的姓名和地址。
柯南打开邀请函，里面的内容让他眉头紧皱。
“尊敬的柯南先生，我知道您破解了许多谜团，拯救了这座城市多次。但有一个更大的挑战等待着您。今晚午夜，来废弃的钟楼，您将揭开一个惊人的秘密。”
毛利兰看到这封邀请函，担忧地说：“柯南，这可能是个陷阱，我们不能轻易去。”
林羽也附和道：“是啊，太可疑了。”
但柯南却坚定地说：“如果这背后真的隐藏着什么威胁城市安全的秘密，我们不能坐视不管。”
灰原哀沉默片刻后说道：“那我们一起去，相互有个照应。”
于是，午夜时分，柯南等人来到了废弃的钟楼。四周寂静无声，只有月光洒在破旧的建筑上。
当他们走进钟楼，里面突然亮起了灯光。
“欢迎各位的到来。”一个陌生的声音响起。
他们循声望去，只见一个戴着面具的人站在高处的平台上。
“你是谁？为什么把我们叫来这里？”柯南问道。
面具人笑了笑：“别着急，孩子们。我叫你们来，是因为这座城市即将面临一场巨大的灾难。”
毛利小五郎大声说：“少在这里危言耸听！”
面具人摇摇头：“信不信由你们，但如果你们不听我说，后果不堪设想。”
面具人接着说：“在城市的地下，有一个巨大的炸弹，足以将整个城市夷为平地。”
“什么？”众人惊呼。
“而解除炸弹的关键，就在一个神秘的密码。”面具人继续说道。
柯南冷静地思考着：“你为什么要告诉我们这些？”
面具人冷笑一声：“因为只有你们有能力找到这个密码，拯救城市。”
说完，面具人消失了。
“可恶，跑了！”毛利小五郎气愤地说。
“先别管他，我们得赶紧找到炸弹和密码。”柯南说道。
他们开始在钟楼里寻找线索。林羽利用他的科技设备检测着周围的环境，灰原哀则仔细分析着面具人留下的话语。
“我发现了一些奇怪的符号。”毛利兰喊道。
柯南跑过去查看：“这可能是密码的一部分提示。”
就在他们紧张地寻找线索时，突然听到了外面传来的动静。