在警方的护送下，柯南等人暂时摆脱了“暗影”组织的追捕。但他们清楚，敌人不会轻易放弃，必须尽快为宝物找到一个安全的安置之所。
“我们不能把宝物交给普通的警方，‘暗影’组织的势力可能渗透到了各个角落。”柯南忧心忡忡地说道。
毛利兰皱起眉头：“那我们该怎么办？”
林羽思索片刻：“我知道有一个地方，是一个极其机密且安全的研究所，专门研究和保护珍贵的物品。”
众人决定前往这个研究所。
一路上，他们小心翼翼，警惕着周围的任何风吹草动。终于，他们来到了研究所的门口。
研究所的负责人是一位名叫大卫的博士，他听完柯南等人的叙述，表情严肃地说道：“这件宝物关系重大，我们会尽最大的努力保护它。”
宝物被安置在了研究所最核心的保险库中，那里有着最先进的安保系统。
然而，就在他们以为暂时安全的时候，研究所却发生了一系列奇怪的事情。一些工作人员突然失踪，监控系统也时不时出现故障。
“这绝对不是巧合，‘暗影’组织可能已经渗透进来了。”柯南说道。
他们开始暗中调查。灰原哀在失踪人员的工作区域发现了一些可疑的脚印和奇怪的化学试剂残留。
“这些试剂似乎是用来破坏安保系统的。”灰原哀分析道。
毛利小五郎在检查监控记录时，发现了一些画面被篡改的痕迹。
“有人在刻意掩盖他们的行踪。”毛利小五郎说道。
就在这时，研究所的电力系统突然遭到破坏，整个研究所陷入了黑暗。
“大家小心！”柯南喊道。
一阵混乱中，传来了几声惨叫。
灯光重新亮起时，他们发现又有几名工作人员倒在了血泊中。
“必须尽快找出内鬼，不然我们都有危险。”大卫博士说道。
柯南等人分散开来，在研究所内展开搜索。